Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf72Q96LT7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms