Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SGCZQ96LD1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms