Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RNF183Q96D59 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RNF183Q96D59 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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RNF183Q96D59 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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RNF183Q96D59 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RNF183Q96D59 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RNF183Q96D59 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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RNF183Q96D59 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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RNF183Q96D59 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
RNF183Q96D59 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
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