Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NEIL2Q969S2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms