Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HLA-CQ95604 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
HLA-CQ95604 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms