Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TOPBP1Q92547 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TOPBP1Q92547 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms