Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113Q902F9 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms