Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZNF548Q8NEK5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZNF548Q8NEK5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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ZNF548Q8NEK5 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ZNF548Q8NEK5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ZNF548Q8NEK5 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ZNF548Q8NEK5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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ZNF548Q8NEK5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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ZNF548Q8NEK5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF548Q8NEK5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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