Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms