Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
LINC00612Q8N6U2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms