Protein–RNA interactions for Protein: Q86YD3

TMEM25, Transmembrane protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM25Q86YD3 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM25Q86YD3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms