Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KCNMB4Q86W47 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms