Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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SNX20Q7Z614 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SNX20Q7Z614 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SNX20Q7Z614 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SNX20Q7Z614 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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SNX20Q7Z614 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX20Q7Z614 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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