Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SETXQ7Z333 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SETXQ7Z333 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SETXQ7Z333 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SETXQ7Z333 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SETXQ7Z333 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SETXQ7Z333 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SETXQ7Z333 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SETXQ7Z333 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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SETXQ7Z333 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SETXQ7Z333 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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SETXQ7Z333 CIDEC-205ENST00000443115 443 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SETXQ7Z333 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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