Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PDZD4Q76G19 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms