Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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USP53Q70EK8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
USP53Q70EK8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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