Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC141Q6ZP82 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC141Q6ZP82 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms