Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
C16orf54Q6UWD8 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100 ms