Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
FBXO38Q6PIJ6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
FBXO38Q6PIJ6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FBXO38Q6PIJ6 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FBXO38Q6PIJ6 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FBXO38Q6PIJ6 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
FBXO38Q6PIJ6 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms