Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBA3EQ6PEY2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBA3EQ6PEY2 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms