Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM46CQ5VWP2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms