Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
AGAP9Q5VTM2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AGAP9Q5VTM2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms