Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HES3Q5TGS1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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