Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SP6Q3SY56 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
SP6Q3SY56 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms