Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
KRTAP20-2Q3LI61 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms