Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
EDRF1Q3B7T1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
EDRF1Q3B7T1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms