Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GEN1Q17RS7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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