Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DUSP6Q16828 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DUSP6Q16828 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
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