Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HIF1AQ16665 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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