Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SLC18A3Q16572 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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