Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
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SSX1Q16384 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
SSX1Q16384 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
SSX1Q16384 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
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