Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NPTX1Q15818 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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