Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PDCD1Q15116 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
PDCD1Q15116 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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