Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLD3Q15054 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
POLD3Q15054 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms