Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NCAPHQ15003 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms