Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHPRHQ149N8 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
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