Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RAB39AQ14964 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms