Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SMCO1Q147U7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SMCO1Q147U7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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