Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCARF1Q14162 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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