Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
RASGRF1Q13972 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RASGRF1Q13972 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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