Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CUL3Q13618 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CUL3Q13618 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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