Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CUL1Q13616 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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