Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLN3Q13286 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN3Q13286 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CLN3Q13286 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CLN3Q13286 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLN3Q13286 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN3Q13286 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CLN3Q13286 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CLN3Q13286 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CLN3Q13286 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CLN3Q13286 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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