Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RLFQ13129 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RLFQ13129 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RLFQ13129 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RLFQ13129 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RLFQ13129 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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