Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NFX1Q12986 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NFX1Q12986 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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