Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
STX4Q12846 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
STX4Q12846 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms