Protein–RNA interactions for Protein: Q10587

TEF, Thyrotroph embryonic factor, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFQ10587 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TEFQ10587 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TEFQ10587 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TEFQ10587 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TEFQ10587 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TEFQ10587 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TEFQ10587 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TEFQ10587 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TEFQ10587 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TEFQ10587 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TEFQ10587 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TEFQ10587 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TEFQ10587 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TEFQ10587 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TEFQ10587 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TEFQ10587 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TEFQ10587 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TEFQ10587 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms