Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
RIPPLY1Q0D2K3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms