Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPAL4Q0D2K0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms