Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KRTAP1-1Q07627 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KRTAP1-1Q07627 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms